2015年1月26日,科技部張來武副部長一行來到了位于浦東孫橋現代農業園區的AgriPhenoTM平臺,對這個亞洲唯一的高通量植物基因型-表型-育種服務平臺進行了考察。
隨著基因組學的快速發展,研究人員發現了許多與抗逆、高產、高效(利用水分、營養鹽)功能相關的備選基因,加速了新功能基因的發掘和新植物品種的構建,這些品種/種質是人類未來發展的巨大財富。如何對植物表型進行高通量地測量和分析是目前研究新性狀和新品種的限制因素。新品種選育受到慢且主觀的手工表型分析的困擾,以更高的精度和速度將基因功能、植物表型和環境應答聯系起來,這種需求比任何時候更加迫切。
表型組學可以利用目標群體詳細的表型信息為功能基因組學提供良好的研究工具。國際上一些公司和研究機構為了搶占先機,投入大量的資金和人力用于建設表型組學平臺,如先鋒,孟山都、先正達、拜耳、巴斯夫、英國國家植物表型組學中心,歐洲植物表型組平臺,澳洲植物表型組學中心等等。
近年來,我國在植物科學領域取得了不少進步,尤其是在重要的農作物研究上如水稻基因組學、功能基因、水稻突變體庫、遺傳育種等,在國際上具有重要的學術地位。然而我們的大部分研究還停留在基因層面的研究,不能全面、徹底地闡明作物的生理功能,特別是作物表型與其產量、生理狀態之間的相互關系,以及不同的環境條件對作物生長狀況、產量、種質質量等的影響。這就需要對作物進行表型組學的研究,通過研究不同的表型性狀來確定作物的遺傳性狀,并且尋找不同環境因子對作物各種指標影響的閾值,從而能夠更加科學地闡明作物生長機理,指導作物生產。
AgriPhenoTM平臺擁有國際上最先進的價值數千萬元的高通量表型設備,而這種高通量表型設備是制約現代分子育種、基因及性狀挖掘、功能基因組學等發展的瓶頸之一。AgriPhenoTM是一個公共科研服務平臺,客戶不需投入巨資去建設平臺,只需設計好實驗,花費少量的經費即可完成研究或育種工作。
AgriPhenoTM平臺采用“溫室自動化 + 高通量成像”技術,將機器人技術、圖像分析和大規模計算能力完美結合,對大量植株進行全自動、高通量的植物表型測量。該表型平臺包括傳送帶、成像模塊、“暗房”、運輸車、澆水和稱重裝置、控制系統等。其中傳送帶、運輸車和植物在溫室中運轉,所有的植物可以由軟件控制在傳送帶上進行動態分布,以避免由于溫室中的光、溫、濕分布不均勻造成的影響;成像模塊、“暗房”、澆水和稱重裝置安裝在獨立的空調房中,并通過傳送帶與溫室相連。該平臺可以高通量獲取植物葉片長度、寬度、葉角度、葉面積,植株莖干直徑,植株高度、寬度和密度,植株生長速率,植株脅迫環境下的色素變化,植株緊湊性(葉角度和緊密性),植株和葉片的顏色分析,包含發育狀態、病理學等信息,植株節間高度,植株葉片卷曲程度、葉傾角,植物水分生理等等表型參數。
張副部長對AgriPhenoTM平臺給予了高度肯定,并鼓勵澤泉科技把平臺建設好,為促進我國農業育種的快速發展發揮助推器的作用。
科技部社會發展科技司、農村科技司、中國生物技術發展中心、上海市科學技術委員會、孫橋現代農業園區等單位的領導陪同張副部長一同進行了考察。