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應用自動在線流式細胞術實時監測海洋海岸微生物濃度
日期:2023-03-16 16:21:08
摘要

海(hai)(hai)洋(yang)微(wei)生(sheng)(sheng)物(wu)(wu)無處(chu)不(bu)在(zai),通過光合作(zuo)用和(he)(he)(he)生(sheng)(sheng)物(wu)(wu)地(di)球化學循(xun)環等關(guan)鍵過程,在(zai)海(hai)(hai)洋(yang)中發揮著基(ji)本(ben)作(zuo)用。由于(yu)其很高的(de)(de)(de)(de)更替頻率(lv)和(he)(he)(he)不(bu)完整(zheng)的(de)(de)(de)(de)分布(bu),監(jian)(jian)測時(shi)(shi)需要(yao)在(zai)正確的(de)(de)(de)(de)時(shi)(shi)間和(he)(he)(he)空間取樣(yang)。使(shi)用兩個在(zai)線(xian)流式(shi)細(xi)胞儀系統對(dui)那不(bu)勒(le)斯灣沿(yan)岸(an)地(di)區(qu)(qu)的(de)(de)(de)(de)海(hai)(hai)洋(yang)微(wei)生(sheng)(sheng)物(wu)(wu)進行了(le)監(jian)(jian)測,驗(yan)證一(yi)(yi)種新(xin)的(de)(de)(de)(de)概念,證明該(gai)技術可以(yi)作(zuo)為(wei)一(yi)(yi)個實時(shi)(shi)水質報警(jing)系統的(de)(de)(de)(de)有(you)用工具(ju)。建議將(jiang)細(xi)菌和(he)(he)(he)微(wei)型(xing)浮游植物(wu)(wu)濃度(du)(du)作(zuo)為(wei)水質的(de)(de)(de)(de)一(yi)(yi)般(ban)指(zhi)標(biao),這是(shi)評估環境條件變化的(de)(de)(de)(de)影響所(suo)(suo)必(bi)需的(de)(de)(de)(de)第一(yi)(yi)步,隨后(hou)將(jiang)深入(ru)分析群落組成(cheng)是(shi)否存在(zai)病(bing)原體或其他指(zhi)標(biao)。在(zai)調查(cha)期間,我們發現在(zai)未經處(chu)理的(de)(de)(de)(de)城市廢物(wu)(wu)排放區(qu)(qu)或河(he)流輸入(ru)區(qu)(qu)細(xi)菌濃度(du)(du)高。一(yi)(yi)般(ban)說來,細(xi)菌的(de)(de)(de)(de)豐(feng)度(du)(du)與鹽度(du)(du)呈(cheng)負相關(guan),這表(biao)明它們利用陸(lu)地(di)來源(yuan)的(de)(de)(de)(de)有(you)機物(wu)(wu)進行生(sheng)(sheng)長。所(suo)(suo)使(shi)用的(de)(de)(de)(de)技術方(fang)法也(ye)是(shi)根據旨在(zai)評估和(he)(he)(he)改善歐(ou)洲海(hai)(hai)洋(yang)水域質量的(de)(de)(de)(de)歐(ou)洲指(zhi)令2008/56/EC,是(shi)監(jian)(jian)測沿(yan)海(hai)(hai)地(di)區(qu)(qu)的(de)(de)(de)(de)一(yi)(yi)種有(you)用和(he)(he)(he)快速的(de)(de)(de)(de)方(fang)法。
介紹
海洋(yang)(yang)微(wei)生(sheng)(sheng)(sheng)(sheng)物(wu)(wu)(wu)(wu)(wu)具(ju)有(you)(you)高(gao)(gao)度的(de)動態性(xing),對生(sheng)(sheng)(sheng)(sheng)態系統(tong)性(xing)質的(de)變化反(fan)應(ying)(ying)非常快(kuai),從而導致(zhi)急性(xing)污染(ran)事件(jian)為了(le)(le)捕捉這(zhe)些(xie)反(fan)應(ying)(ying)并(bing)確定其原因,需要(yao)高(gao)(gao)頻準(zhun)確的(de)測量。大多數(shu)用(yong)(yong)于(yu)監測海洋(yang)(yang)微(wei)生(sheng)(sheng)(sheng)(sheng)物(wu)(wu)(wu)(wu)(wu)的(de)方(fang)(fang)法(fa)都存在(zai)重復性(xing)低、響(xiang)應(ying)(ying)時間(jian)長和(he)(he)(he)對勞動力要(yao)求(qiu)高(gao)(gao)的(de)問題。流(liu)式細(xi)胞(bao)(bao)術(shu)(shu)提供了(le)(le)一(yi)個解決這(zhe)些(xie)限制的(de)方(fang)(fang)法(fa),允許快(kuai)速(su)、準(zhun)確和(he)(he)(he)可(ke)復制的(de)海洋(yang)(yang)微(wei)生(sheng)(sheng)(sheng)(sheng)物(wu)(wu)(wu)(wu)(wu)計數(shu),并(bing)在(zai)海洋(yang)(yang)生(sheng)(sheng)(sheng)(sheng)態學研究中得到了(le)(le)廣(guang)泛的(de)應(ying)(ying)用(yong)(yong)。流(liu)式細(xi)胞(bao)(bao)術(shu)(shu)是(shi)一(yi)種(zhong)利(li)用(yong)(yong)散射(she)和(he)(he)(he)熒(ying)(ying)(ying)光來鑒別和(he)(he)(he)計數(shu)細(xi)胞(bao)(bao)類型的(de)非軸(zhou)測、基于(yu)單細(xi)胞(bao)(bao)的(de)方(fang)(fang)法(fa)。由(you)于(yu)光合色素的(de)自(zi)(zi)熒(ying)(ying)(ying)光性(xing),光合微(wei)生(sheng)(sheng)(sheng)(sheng)物(wu)(wu)(wu)(wu)(wu)可(ke)以直接(jie)分(fen)析(xi)(xi),而非自(zi)(zi)熒(ying)(ying)(ying)光微(wei)生(sheng)(sheng)(sheng)(sheng)物(wu)(wu)(wu)(wu)(wu)(如(ru)異養(yang)細(xi)菌)則需要(yao)在(zai)分(fen)析(xi)(xi)前進行染(ran)色。染(ran)色步驟需要(yao)樣品處理和(he)(he)(he)孵育(yu)時間(jian),這(zhe)是(shi)正確評估細(xi)胞(bao)(bao)濃度所必需的(de)。在(zai)環境科學中,自(zi)(zi)動流(liu)式細(xi)胞(bao)(bao)術(shu)(shu)已用(yong)(yong)于(yu)自(zi)(zi)發熒(ying)(ying)(ying)光微(wei)生(sheng)(sheng)(sheng)(sheng)物(wu)(wu)(wu)(wu)(wu)和(he)(he)(he)染(ran)色后(hou)的(de)異養(yang)細(xi)菌。我們將這(zhe)兩種(zhong)方(fang)(fang)法(fa)結合起來,分(fen)別使用(yong)(yong)了(le)(le)用(yong)(yong)于(yu)在(zai)線分(fen)析(xi)(xi)光營養(yang)微(wei)生(sheng)(sheng)(sheng)(sheng)物(wu)(wu)(wu)(wu)(wu)的(de)Cytosense(CytoBuoy BV)和(he)(he)(he)連接(jie)到海洋(yang)(yang)航行船(chuan)的(de)泵(beng)的(de)OnCyt自(zi)(zi)動流(liu)式細(xi)胞(bao)(bao)儀(OnCyt Microbiology AG)。證明(ming)了(le)(le)高(gao)(gao)空間(jian)分(fen)辨率監測表面微(wei)生(sheng)(sheng)(sheng)(sheng)物(wu)(wu)(wu)(wu)(wu)分(fen)布(bu)是(shi)可(ke)行的(de),并(bing)提供了(le)(le)有(you)(you)用(yong)(yong)的(de)第一(yi)手信息,可(ke)用(yong)(yong)于(yu)快(kuai)速(su)和(he)(he)(he)實時地指示水質。
材料和方法

2017年6月19日在RV Vettoria上采樣。地表水由船泵通過在線熱鹽計 (SBE45 MicroThermalSalinograph,Seabird Electronics),測量溫度和鹽度,并通過在線熒光計測量總熒光(CycloPS7,Turner Design 連接databank)。然后,水流過采樣裝置(Cytobuy BV),并依次通過Cytosense流式細胞儀(Cytobuy BV)和OnCyt在線流式細胞儀。

Cytosense每2分鐘分析一次樣品,而OnCyt每13分鐘(取決于染色時間)分析一次樣品,對應每1km 采樣一次,取決于船速。常規流式細胞儀分析的離散樣本每10分鐘在表面采集一次,以驗證onCyt計數。在,將這些樣品固定、冷凍并稍后在實驗室用SYBRGreen染色后進行分析。從CytoSense中,獲得了Synechochoccus sp(藍藻)、微微真核生物(1-3μm大小的混合種群)和納米真核生物的計數(2-10μm大小),同時onCyt提供非熒光,主要是養細菌的濃度。
結果與討論(lun)

盡(jin)管(guan)對于自養微微浮游生物(wu)(wu)(藍(lan)藻和(he)(he)(he)微微真核(he)(he)生物(wu)(wu)),onCyt系(xi)(xi)統(tong)與傳統(tong)流式細(xi)(xi)胞(bao)術的比(bi)較已(yi)(yi)有(you)報道,而且對于異養微生物(wu)(wu),onCyt系(xi)(xi)統(tong)已(yi)(yi)用(yong)(yong)(yong)于淡水系(xi)(xi)統(tong),但其在海水中(zhong)的應用(yong)(yong)(yong)仍需測試。因此,我(wo)們調整了染色方案,以適應onCyt在培養溫(wen)度和(he)(he)(he)時間方面的需要。為了保證測量的準確性,在含50 mM EDTA染色之前,樣(yang)品中(zhong)加入多聚甲醛和(he)(he)(he)戊二(er)醛的混合物(wu)(wu)(1%和(he)(he)(he)0.05%最終濃度)。使用(yong)(yong)(yong)CytSense和(he)(he)(he)onCyt獲(huo)得的細(xi)(xi)胞(bao)計數與通過常規流式細(xi)(xi)胞(bao)術獲(huo)得的計數顯(xian)著正相關(guan),如圖所示,對于細(xi)(xi)菌,計數和(he)(he)(he)亞群(高(gao)核(he)(he)酸(suan)(suan),HNA和(he)(he)(he)低核(he)(he)酸(suan)(suan),LNA,圖1c和(he)(he)(he)d)都適用(yong)(yong)(yong)。


圖123031504.jpg

圖1 通過CytoSense、onCyt和常規流式細胞(Verse)獲得的數據驗證。

a)CytoSenseVs Verse藍藻聚球藻計(ji)數(shu)的(de)相關性(xing)b)onCyt Vs Verse總異養(yang)(yang)細(xi)(xi)(xi)菌(jun)計(ji)數(shu)的(de)相關性(xing)c)通過onCyt獲得的(de)異養(yang)(yang)細(xi)(xi)(xi)菌(jun)的(de)流(liu)(liu)式(shi)圖d)通過Verse獲得的(de)異養(yang)(yang)細(xi)(xi)(xi)菌(jun)生的(de)流(liu)(liu)式(shi)圖


上(shang)船(chuan)后,兩臺(tai)流(liu)式細胞儀(yi)在(zai)熱鹽分析儀(yi)之(zhi)后連(lian)接到船(chuan)上(shang)的采(cai)樣線(xian)(xian)上(shang)。然后海水被分成兩條(tiao)線(xian)(xian),一條(tiao)通向(xiang)CytSense,另一條(tiao)通向(xiang)onCyt。兩臺(tai)儀(yi)器同時(shi)采(cai)集了樣本(ben)。


圖223031504.jpg

圖2 顯示了船的軌(gui)跡以及(ji)巡航期(qi)間(jian)收集的溫度、鹽度和(he)熒光值。

兩個低鹽(yan)度(du)區(qu)域很(hen)明顯,一個靠近港口(Torre Annunziata),另一個位(wei)于受(shou)薩(sa)諾河(Sarno)影響的區(qu)域。第(di)一個位(wei)于離海岸一英里的城(cheng)(cheng)市垃圾收(shou)集站附(fu)近。第(di)二條河流與薩(sa)諾河相對應,薩(sa)諾河流經(jing)幾(ji)個農村和城(cheng)(cheng)市地(di)區(qu),然(ran)后排入(ru)那不勒(le)斯灣。a)溫度(du),b)葉綠素熒光,c)航跡,d)鹽(yan)度(du)。箭頭表(biao)示鹽(yan)度(du)較低的地(di)點,Torre Annunziata(上圖(tu))和Sarno(下(xia)圖(tu))


細(xi)菌總濃度(du)顯示(shi)出這兩個(ge)區域對應的(de)峰值,第(di)一(yi)個(ge)區域(Torre Annunciata)的(de)最(zui)高濃度(du)為(wei)(wei)1.5 x 106cell/ml,第(di)二個(ge)區域(Sarno)的(de)濃度(du)為(wei)(wei)1.4 x 106cell/ml(圖(tu)3)。盡管HNA在(zai)Torre Annunziata占(zhan)主導(dao)地位(wei),但(dan)HNA和(he)LNA均存(cun)在(zai)于Sarno現(xian)場(未顯示(shi)),表(biao)明采樣(yang)軌跡沿線(xian)的(de)群(qun)落組成發生(sheng)了(le)變化。事實上,HNA和(he)LNA現(xian)在(zai)被(bei)識別為(wei)(wei)不同的(de)細(xi)菌集群(qun),最(zui)終代表(biao)了(le)相同的(de)較大分支,但(dan)屬(shu)于不同的(de)分類(lei)單元,而(er)不像以前(qian)認為(wei)(wei)的(de)那(nei)樣(yang),是更多(HNA)或更少(shao)(LNA)活性細(xi)菌。


圖323031504.jpg

圖3 樣本軌跡(左側(ce))和中異養細菌總濃度(右側(ce))cell/ ml

在(zai)(zai)Sarno現場采(cai)集(ji)的(de)樣(yang)本顯示存在(zai)(zai)大腸桿(gan)菌(jun),這(zhe)是(shi)近期(qi)糞便污染(ran)的(de)指標,但(dan)在(zai)(zai)Torre Annunziata現場(Milva Pepi,pers.Comm.)沒有,這(zhe)表明(ming)在(zai)(zai)僅根據(ju)細菌(jun)總(zong)濃度正確評估人類(lei)健康(kang)風(feng)險之前(qian),進一步(bu)進行細菌(jun)分(fen)析的(de)重(zhong)要性。有毒藻(zao)類(lei)也是(shi)如此,其(qi)中單(dan)獨的(de)分(fen)類(lei)鑒定(ding)并不總(zong)是(shi)與必(bi)須(xu)使(shi)用其(qi)他適當的(de)檢(jian)測方法(fa)證明(ming)的(de)毒素(su)的(de)存在(zai)(zai)相對應。

自養(yang)微(wei)(wei)生物(wu)組分(fen)也顯示出兩個區(qu)域之間(jian)的(de)(de)明顯分(fen)離,藍(lan)(lan)細(xi)菌聚球藻(Synechococcus)在南部(bu)地區(qu)占優(you)勢(shi),而微(wei)(wei)微(wei)(wei)真核(he)生物(wu)和隱藻在北(bei)部(bu)地區(qu)占優(you)勢(shi)(圖(tu)4)。這也證實了先前的(de)(de)觀(guan)察結(jie)果,表明原(yuan)核(he)生物(wu)(藍(lan)(lan)藻)與大型真核(he)生物(wu)(微(wei)(wei)微(wei)(wei)真核(he)生物(wu)和隱藻)對不同的(de)(de)環境線(xian)索做出反應,后者通常負責總葉綠素的(de)(de)峰值(如(ru)熒光模式所示,圖(tu)1b)。


圖423031504.jpg

圖4 樣本軌跡(左側)和a)聚球(qiu)藻(zao)b)微(wei)微(wei)真(zhen)核生物c)隱(yin)藻(zao)濃度cell/ml
結論

自(zi)動高(gao)頻流式細(xi)(xi)胞儀被證明是一種檢測海(hai)洋(yang)微生物的(de)成本效(xiao)益高(gao)、速度快的(de)方(fang)法,允許實時測量細(xi)(xi)胞濃度與環(huan)(huan)境(jing)因(yin)素相(xiang)關性,以(yi)便(bian)解釋和潛在地(di)用(yong)作水(shui)(shui)質(zhi)標(biao)志,并為進一步干預鋪平道路。反(fan)過(guo)來,微生物群落,特(te)別是異養細(xi)(xi)菌(jun),似(si)乎(hu)是環(huan)(huan)境(jing)條件變化的(de)有用(yong)標(biao)志,需要考慮(lv)并納入水(shui)(shui)質(zhi)評估,如歐洲指令2008/56/EC所要求(qiu)的(de),其(qi)目標(biao)是在2020年內達到所有歐洲水(shui)(shui)域的(de)良(liang)好環(huan)(huan)境(jing)狀態(GES)。

由于細菌(jun)細胞總數可(ke)能(neng)不會進一(yi)(yi)步反映致(zhi)病性或毒性對人類健康的(de)風險,因此必須謹慎(shen)行事。然而,流式細胞術可(ke)能(neng)是首(shou)次篩選的(de)一(yi)(yi)種有價值的(de)方法,實(shi)時預警潛在(zai)的(de)關鍵位點,以(yi)便(bian)通過其他方法進一(yi)(yi)步監(jian)測和控制(zhi)。

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