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野外型高通量植物表型平臺——Field Scanalyzer
日期:2017-04-24 15:27:25

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1  自動化 FieldSystem 系統

Scanalyzer Field 是(shi)利用(yong)門式起重系統二(er)設計和組建的(de)3軸(zhou)表型系統,X軸(zhou)方向(xiang)的(de)運動是(shi)通過軌道系統進入地面,以允許(xu)自然排水和無障(zhang)礙運行,如傳統的(de)混(hun)凝土地基可以充當(dang)流動屏障(zhang),Y軸(zhou)垂(chui)直(zhi)于軌道,并且承擔攝(she)像機設置的(de)升降(jiang)裝置,Z軸(zhou)描述的(de)是(shi)升降(jiang)單元(yuan)上(shang)下移動的(de)方向(xiang)。

X軸(zhou)運動(dong)單元(yuan)(yuan)是由(you)兩個變(bian)頻有源電(dian)(dian)源和(he)(he)(he)兩個無源單元(yuan)(yuan),將被綁定在支撐梁上,Y軸(zhou)包(bao)括門式(shi)框架(鋁),并(bing)將保護Z軸(zhou)的運動(dong),Scanalyzer Field 系統的推進包(bao)括兩個電(dian)(dian)動(dong)逆(ni)變(bian)器(qi)(qi)供電(dian)(dian)引擎(qing),驅動(dong)底部兩個齒輪傳輸,Y軸(zhou)和(he)(he)(he)Z軸(zhou)同樣是由(you)電(dian)(dian)動(dong)逆(ni)變(bian)器(qi)(qi)和(he)(he)(he)齒條(tiao)一起供應運轉。

這樣的設(she)置可以使系(xi)統精密的在X、Y和Z軸(zhou)上運動。

Scanalyzer Field 系(xi)統(tong)上(shang)的運行部件均(jun)來自(zi)其他手動(dong)或自(zi)動(dong)操作(zuo)的系(xi)統(tong),比如船舶和(he)火車卸貨等,因此Scanalyzer Field 系(xi)統(tong)的零件具有更耐久性和(he)靈活性。

 

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圖(tu)1: ScanalyzerField系(xi)統示(shi)意圖(tu)

 

1.1 系統參數

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1.2  系統操作注意事項

開(kai)始的時候,接(jie)受過培訓的人員利(li)用(yong)遠程操(cao)作進行系統的運行;

每(mei)個試驗(yan)地的開(kai)始(shi)和結束位置,本(ben)步驟在每(mei)一個試驗(yan)開(kai)始(shi)前進(jin)行,在播種前就要做(zuo)好(hao);

一旦實驗設(she)置被保存,用戶需要(yao)使用控制軟件選取接下來的參數(shu),參數(shu)包括時間(jian)、頻率、地點等(deng);

保(bao)證所有的圖像(xiang)之間都(dou)有重復,保(bao)證每一個植(zhi)株都(dou)會(hui)被測量到;

熒光測量時,如果是在晚上,要充分考慮到熒光對周(zhou)圍植株(zhu)的影響,不能緊接(jie)著進行測量。

1.3  系統精確度

ScanalyzerField 系(xi)統的精(jing)度可(ke)以達到X軸<±50mm,Y軸<±5mm和Z軸<±5mm,除GPS定位外,每張照(zhao)片都(dou)包含在ScanalyzerField系(xi)統三維空間的位置。

1.4  系統耐久性

因為所有的(de)部(bu)件都采用(yong)工業(ye)標準,加載的(de)重量遠遠低(di)于設(she)計時的(de)承(cheng)重能力,ScanalyzerField 系統可以(yi)持續使用(yong)5年以(yi)上(shang)的(de)時間。

1.5  系統維護

盡管相機(ji)朝下且有保護附件,但是(shi)為了保證(zheng)成(cheng)像質量(liang),常規(gui)的清(qing)潔仍(reng)是(shi)必要的,如(ru)果下大雨,有必要清(qing)潔一下相機(ji)的外殼(ke),清(qing)除(chu)殘余的水和殘渣。

在植(zhi)物的生長季,如果ScanalyzerField 系(xi)統(tong)每天都要(yao)工作,那么每年進(jin)行一次(ci)檢查(cha)和預(yu)防性維(wei)護是非常必(bi)要(yao)的。

維(wei)護(hu)包括檢查所有滑動部(bu)件的潤滑性(xing),也要(yao)對成像傳感器進(jin)行(xing)檢測,在儀器運行(xing)的前三年,不會跟換新的部(bu)件。

1.6  系統安全方案

1.6.1  ScanalyzerField系統常見風險

自動模式:

系(xi)統(tong)(tong)自(zi)動運行時(shi),人員(yuan)不能站在ScanalyzerField系(xi)統(tong)(tong)軌道(dao)間的任何區域;

ScanalyzerField系統(tong)會按(an)照編輯的(de)程序沿軌(gui)道進行(xing)運(yun)動(dong),任何站在系統(tong)上方或離軌(gui)道較近的(de)人員,都會有(you)與ScanalyzerField系統(tong)碰(peng)撞的(de)危險,系統(tong)自動(dong)運(yun)動(dong)的(de)速度(du)最大可達60min/min;

自動(dong)(dong)運行(xing)模式下,圖像采集臂可以在(zai)2米以下高度移動(dong)(dong);

熒光成(cheng)像技術(shu)使用(yong)短(duan)LED脈(mo)沖(1-2s),亮(liang)度相當于太陽光的4-6倍;

高度掃(sao)描設備包括可見激光(guang)。

手動模式:

手(shou)動模式(shi)下(xia),操作者就會在運行系統的周(zhou)邊,并(bing)且成像時,操作者需要與系統直接(jie)(jie)接(jie)(jie)觸(chu);

系統不運(yun)行的(de)情況下(xia),傳感器的(de)蓋子(zi)被打開(kai)(kai),所有的(de)安全模塊開(kai)(kai)啟且顯示危險警(jing)告。

1.6.2  ScanalyzerField系統風險應對

技術性

導軌放在(zai)土層以上,減少人員站在(zai)導軌上的風險;

ScanalyzerField系(xi)統會產生聲音和燈光信號,提醒周圍的工作人員(yuan);

ScanalyzerField系(xi)統的導軌如(ru)果碰到(dao)物體,不論在手動(dong)狀態(tai)或自(zi)動(dong)狀態(tai),緊急開關會將ScanalyzerField系(xi)統緊急停(ting)止,

安全(quan)保險不能使用,因(yin)此(ci)系統有大約1m左右的斷裂長(chang)度。

人工控(kong)制ScanalyzerField系統時,可以使用緊急暫停按鈕。

人工操作時(shi),ScanalyzerField系統運行時(shi)的(de)速度是(shi)有限制的(de)。

當(dang)人(ren)工(gong)操作系統時,激(ji)光和熒光的光源是停用(yong)的。

當遇到極端(duan)惡劣環境(jing)時(shi),自(zi)動運行模式不能維持,ScanalyzerField系統會進入安全位置。

1.6.3  系統組織培訓

ScanalyzerField系統(tong)的操作者(zhe)會接(jie)受單獨培訓。

系統維護人員需要(yao)較好掌握技(ji)術教育,并且接受ScanalyzerField系統的培訓。

整個ScanalyzerField系(xi)統(tong)的(de)外側都應(ying)安(an)(an)裝有2m高的(de)柵欄,并且(qie)進入柵欄區域的(de)應(ying)該是接受過培訓的(de)人,入口處應(ying)該粘貼安(an)(an)全條(tiao)例。

 

2  傳感器平臺

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圖 2: 傳感(gan)器平臺概念圖(最終(zhong)版本可能有所不同)

 

每一種(zhong)相(xiang)機系統(tong)都單獨安裝在(zai)密(mi)封殼體內,并(bing)綁定(ding)在(zai)靈活(huo)可(ke)調的(de)成像盒中,照相(xiang)機箱的(de)總有效載荷(he)可(ke)以達到500公斤,允許靈活(huo)的(de)增加傳感器。

主要特點:

天氣保護平臺(tai),單(dan)獨保護傳(chuan)感器;

卷簾門在平臺下面的對面,充分保護(hu)不(bu)在使用(yong)的傳感器;

夜間使用的(de)鹵素燈同時(shi)具(ju)有加熱元件,可以防止(zhi)傳(chuan)感器溫度(du)過低而表面水分凝(ning)結。

大小:

3m 寬

1.5m 高

1.5m 深度

載重:

500kg

 

2.1 FLIR 紅外相機

相機與樣(yang)品距離、大氣溫度、相對濕度等環境參數對測量結(jie)果(guo)影響(xiang)很(hen)大,因此(ci)定期的(de)重校準很(hen)有必要。

結合前(qian)景/背景分(fen)離(li),可以(yi)提取(qu)出不(bu)同植(zhi)物(wu)的(de)精確(que)溫(wen)(wen)度,溫(wen)(wen)度的(de)高低將(jiang)以(yi)假色圖像(xiang)的(de)形(xing)式表現出來(lai),從(cong)而更(geng)容易(yi)觀察(cha)到(dao)(dao)顏色的(de)變(bian)化,紅(hong)外傳感器所得到(dao)(dao)的(de)數據可以(yi)以(yi)柱狀(zhuang)圖的(de)形(xing)式表現出來(lai),從(cong)而分(fen)析植(zhi)物(wu)的(de)溫(wen)(wen)度分(fen)布。

成像和光學參數

焦距        &nbsp;                   

空(kong)間分辨(bian)率(IFOV)

鏡頭識別

焦距比數

熱敏度/NETD

像頻(pin) (SC645) 

像(xiang)頻 (SC 665) 

聚焦(jiao)       ;               &nbsp;              


24.5 mm (0.96 in.)

0.69 mrad

自動

1.0

< 0.05°C ,+30°C下 (+86°F) / 50 mK

25 Hz

50 Hz (100/200 Hz 和開窗)

自動或(huo)手動 (內裝電(dian)動機)

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2.2 RGB 相機 

界面      &nbsp; 

分辨率

傳感器

傳感器類型

傳感器尺寸

電池尺寸

透鏡支架

A/D

On-board FIFO

IEEE 802.3 1000baseT   

3296 x 2472 

Truesense KAI-08050  

CCD 漸進

4/3式

5.5 μm

F-Mount

14 bit

128 MB

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2.3 高光譜傳感器

表1 : 文獻中(zhong)發表的高光(guang)譜指數

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彩色(se)條(tiao)顯示(shi)的(de)是某(mou)些指數(shu)所需要(yao)的(de)光譜范(fan)圍,綠色(se)和黃(huang)色(se)條(tiao)可以通(tong)過VNIR相機成像(380-1000nm),黃(huang)色(se)和紅色(se)條(tiao)可以通(tong)過VNIR相機(550-1700nm),近紅外相機不包含(han)900nm以下的(de)范(fan)圍,對于SWIR相機,已知的(de)參數(shu)主要(yao)在纖維(wei)素和木質素相關的(de)參數(shu)。

為了彌補(bu)不斷變(bian)化(hua)的現場光線(xian),補(bu)償(chang)性設備會提供適量的光源(yuan),附(fu)加光源(yuan)為鹵(lu)素燈,并(bing)且范圍在500到2500納(na)米。

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圖3: 附加(jia)光(guang)源的(de)亮度(du)


2.4 激(ji)光(guang)掃描器

從(cong)上部觀察的(de)高度掃描儀(yi)是Frauenhofer IIS研究機構專門為Lemna Tec公司開發。

使用NIR激光掃描(miao)器可以(yi)避免影響植物的(de)正常生(sheng)理,使用非常高(gao)的(de)分辨率(lv)和很小的(de)時間間隔(ge)。

頂(ding)部(bu)視圖時(shi),兩個單(dan)元將結合起來,詳(xiang)見(jian)圖4.

兩個單元的(de)交(jiao)叉(cha)可以減少(shao)樹冠(guan)陰影面積的(de)影響(xiang)。

在側面掃描時,每個(ge)側視(shi)圖(tu)由四(si)個(ge)單元(yuan)組合(he)成一個(ge)傳感器(qi),光(guang)學元(yuan)件(jian)和角度的選擇將根據臺架安(an)裝(zhuang)的設計而改(gai)變。

每(mei)一個單元都包含(han)傳感器(qi)頭和電(dian)腦(nao),將傳感器(qi)信息結合到plc文件(jian)里(li)。

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圖4: 激光掃描(miao)設(she)備從(cong)上部掃描(miao)植物冠(guan)層


2.5  用于PSII研究的熒光相機

熒(ying)(ying)光相機是使用(yong)直接熒(ying)(ying)光值,目前(qian)有一篇文獻(Strasser, R. J., A. Srivastava, and M. Tsimilli-Michael. "The fluorescence transient as a tool to characterize and screen photosynthetic samples." Probing photosynthesis: mechanisms, regulation and adaptation (2000): 445-483.)解釋為(wei)什么Lemna Tec會選擇直接熒(ying)(ying)光測(ce)定,或被稱為(wei)PAM直接熒(ying)(ying)光法(fa):

目前(qian)使用的(de)(de)(de)(de)有兩種(zhong)熒(ying)(ying)(ying)光(guang)(guang)(guang)(guang)(guang)(guang)(guang)(guang)技術,直接熒(ying)(ying)(ying)光(guang)(guang)(guang)(guang)(guang)(guang)(guang)(guang)和(he)(he)調(diao)(diao)(diao)制(zhi)(zhi)熒(ying)(ying)(ying)光(guang)(guang)(guang)(guang)(guang)(guang)(guang)(guang)技術,每一種(zhong)技術都有優勢和(he)(he)缺(que)陷,隨著技術的(de)(de)(de)(de)發展,光(guang)(guang)(guang)(guang)(guang)(guang)(guang)(guang)電池和(he)(he)光(guang)(guang)(guang)(guang)(guang)(guang)(guang)(guang)電倍增(zeng)管的(de)(de)(de)(de)低(di)(di)靈敏(min)度(du)要求高(gao)的(de)(de)(de)(de)激(ji)發光(guang)(guang)(guang)(guang)(guang)(guang)(guang)(guang)的(de)(de)(de)(de)強度(du),這樣使用直接熒(ying)(ying)(ying)光(guang)(guang)(guang)(guang)(guang)(guang)(guang)(guang)的(de)(de)(de)(de)方法(fa)是比較好的(de)(de)(de)(de),但是有兩個缺(que)點(dian):(a)強大(da)(da)的(de)(de)(de)(de)激(ji)發光(guang)(guang)(guang)(guang)(guang)(guang)(guang)(guang)會引起一個快速的(de)(de)(de)(de)熒(ying)(ying)(ying)光(guang)(guang)(guang)(guang)(guang)(guang)(guang)(guang)上升(sheng);(b)快門開放(fang)的(de)(de)(de)(de)時(shi)間(jian)過長(大(da)(da)約1ms),Fo值無法(fa)測(ce)定。敏(min)感(gan)的(de)(de)(de)(de)光(guang)(guang)(guang)(guang)(guang)(guang)(guang)(guang)電池,光(guang)(guang)(guang)(guang)(guang)(guang)(guang)(guang)電二極管和(he)(he)高(gao)性能放(fang)大(da)(da)器的(de)(de)(de)(de)發展,使得(de)熒(ying)(ying)(ying)光(guang)(guang)(guang)(guang)(guang)(guang)(guang)(guang)信號的(de)(de)(de)(de)測(ce)量具有非(fei)常低(di)(di)的(de)(de)(de)(de)激(ji)發光(guang)(guang)(guang)(guang)(guang)(guang)(guang)(guang)的(de)(de)(de)(de)強度(du),低(di)(di)強度(du)調(diao)(diao)(diao)制(zhi)(zhi)光(guang)(guang)(guang)(guang)(guang)(guang)(guang)(guang)束(shu)激(ji)發衡(heng)量熒(ying)(ying)(ying)光(guang)(guang)(guang)(guang)(guang)(guang)(guang)(guang),初始和(he)(he)最大(da)(da)熒(ying)(ying)(ying)光(guang)(guang)(guang)(guang)(guang)(guang)(guang)(guang)都可以(yi)進行(xing)測(ce)量,并且(qie)精(jing)度(du)很高(gao),但是仍(reng)有兩個限制(zhi)(zhi):(a)該(gai)時(shi)間(jian)分(fen)辨率(lv)由(you)調(diao)(diao)(diao)制(zhi)(zhi)和(he)(he)解調(diao)(diao)(diao)頻(pin)率(lv)的(de)(de)(de)(de)限制(zhi)(zhi);(b)一種(zhong)低(di)(di)成(cheng)本(ben)調(diao)(diao)(diao)制(zhi)(zhi)熒(ying)(ying)(ying)光(guang)(guang)(guang)(guang)(guang)(guang)(guang)(guang)計以(yi)10微秒的(de)(de)(de)(de)時(shi)間(jian)12位信號的(de)(de)(de)(de)分(fen)辨率(lv)不可以(yi)實現。如PEA熒(ying)(ying)(ying)光(guang)(guang)(guang)(guang)(guang)(guang)(guang)(guang)儀,它耗電少且(qie)成(cheng)本(ben)低(di)(di),高(gao)分(fen)辨率(lv)熒(ying)(ying)(ying)光(guang)(guang)(guang)(guang)(guang)(guang)(guang)(guang)上升(sheng)允許人們(men)觀察幾個步驟,F0,K,J,I,P,缺(que)點(dian)是需要外界光(guang)(guang)(guang)(guang)(guang)(guang)(guang)(guang)源,目前(qian),直接熒(ying)(ying)(ying)光(guang)(guang)(guang)(guang)(guang)(guang)(guang)(guang)法(fa)比調(diao)(diao)(diao)制(zhi)(zhi)熒(ying)(ying)(ying)光(guang)(guang)(guang)(guang)(guang)(guang)(guang)(guang)法(fa)有一些(xie)優勢,如每次測(ce)量的(de)(de)(de)(de)信息更(geng)多、低(di)(di)功(gong)耗、高(gao)采樣檢測(ce)率(lv)、重量輕、多種(zhong)環境下采集(ji)數據和(he)(he)成(cheng)本(ben)低(di)(di)。


表2: 儀器可(ke)以測量的熒光參數

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注(zhu):DA:測量暗適應后的參數,在(zai)測量以前(qian),ScanalyzerField系統會保留暗適應的時間,在(zai)測量下一個(ge)植株之前(qian),為避免前(qian)個(ge)植株的影響,這樣的測量要在(zai)晚上(shang)進行。

LA:所(suo)有(you)(you)需要(yao)光(guang)(guang)適應的參數都是在白天進(jin)行(xing),因(yin)(yin)為(wei)兩個不(bu)同相片的光(guang)(guang)密度有(you)(you)可能不(bu)同,因(yin)(yin)此標記LA的參數需要(yao)額外(wai)的處(chu)理(li),所(suo)有(you)(you)的數據才(cai)能夠進(jin)行(xing)比較,同樣,可以(yi)利用激發(fa)光(guang)(guang)的10%作(zuo)為(wei)光(guang)(guang)化光(guang)(guang),用戶可以(yi)在測量前15分鐘調(diao)整光(guang)(guang)適應。

DL:光-暗交替的(de)參數只能是(shi)整個植株的(de)平均值,這(zhe)是(shi)因為植物(wu)的(de)生長和葉片位(wei)置改變所造成(cheng)兩次測量(liang)差異。


2.6  NDVI/PRI 傳感器

NDVI傳感(gan)器運行(xing)一次,便(bian)可(ke)以(yi)快(kuai)速對田間進(jin)行(xing)評(ping)價,NDVI傳感(gan)器同(tong)時可(ke)以(yi)測(ce)量PRI,這種傳感(gan)器適用(yong)于(yu)研(yan)究(jiu)者研(yan)究(jiu)整個田間的參數,而(er)不是單(dan)一的植株。

NDVI 波(bo)段(duan):  630±5 和 800±5 nm 峰值(zhi)波(bo)長, 50納(na)米和40納(na)米的(de)全寬度半最大值(zhi)(FWHM)頻帶寬度。

PRI 波(bo)段:     531±3 和570±3 nm 峰值波(bo)長, 10納米全寬度(du)半最大值(FWHM)頻帶(dai)寬度(du)。

前部光學:

半(ban)球形:余弦校(xiao)正聚四氟乙烯擴散器,市(shi)場(chang)為半(ban)球形;

視場光闌(lan):20°市(shi)場。

校(xiao)準:NIST可溯源校(xiao)準到已知的光譜(pu)福照度(W m-2 nm-1)或(huo)輻射率(W m-2 nm-1 sr-1 )

精度: 光譜輻照度和輻射值在10%或(huo)更高(gao)

測量時間:< 300 ms

外(wai)形尺寸: 43 x 40 x 27mm


2.7  主動反射傳(chuan)感器


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作(zuo)物(wu)冠層傳(chuan)感器Crop Circle ACS-430提供(gong)經典的(de)植物(wu)指數數據(ju)(NDVI和(he)SRI等),以及來自植物(wu)冠層和(he)土壤的(de)基本反射(she)信息(xi)。

與(yu)被(bei)動傳感器不同,Crop Circle ACS-430不會受外界光(guang)強(qiang)的(de)限制,測量可以在白天或夜間(jian)進行。

Crop Circle ACS-430傳感器(qi)可以(yi)安裝(zhuang)到各種類型的車輛上,并且進行(xing)田間測量,緊湊的尺(chi)寸和低重量的設(she)計使Crop Circle ACS-430可以(yi)很容(rong)易地適應支桿安裝(zhuang)和手持式應用(yong)。傳感器(qi)產生的信(xin)息可以(yi)被(bei)用(yong)于定(ding)量的營養物質、水、疾病或其他生長條(tiao)件對植物或作(zuo)物的影響(xiang)。

多通道光譜測量

ACS-430有(you)三個可選的(de)測量(liang)頻道,傳(chuan)(chuan)感器同(tong)時(shi)測量(liang)植物/土壤(rang)在670nm/730nm/780nm處的(de)反射(she)值(zhi),ACS-430傳(chuan)(chuan)感器的(de)主要特點是(shi)測量(liang)時(shi)與(yu)高度(du)(du)無(wu)關,Holland Scientific把這種反射(she)測量(liang)稱作Pseudo Solar Reflectances (PSR)。因(yin)此光譜反射(she)值(zhi)會因(yin)為(wei)傳(chuan)(chuan)感器的(de)高度(du)(du)而改(gai)變,因(yin)此不使用(yong)比例計算(suan),就可以獲得數(shu)十個參數(shu)。(來源(yuan)于: //hollandscientific.com/product/crop-circle-acs-430-active-crop -canopy -sensor/)


2.8 環境傳感器 

2.8.1  天氣傳感器

CLIMA SENSOR US NHTFB(超聲波)傳感器可以實現完全免維護,且(qie)沒有(you)可動磨損部件,如呼吸機或軸(zhou)承等。

本(ben)系(xi)統可連(lian)接例如風(feng)速、風(feng)向(xiang)、聲學(xue)虛擬(ni)溫度(du)、空(kong)氣溫度(du)、相(xiang)對空(kong)氣濕度(du)、亮度(du)、空(kong)氣壓力、降雨量等(deng)傳感器,用于環(huan)境參數(shu)的收集。


2.9  常(chang)規(gui)傳感(gan)器

本系統可加載PAR傳感器(qi)、二氧(yang)化碳傳感器(qi)等。


德(de)國IPK安裝的Rhizotrone根(gen)系分析系統,由德(de)國LemnaTec設(she)計(ji)、德(de)國MK公司施工建設(she)。相關(guan)視頻,請點擊:。


產地:德國LemnaTec

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