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植物根系X射線-CT掃描成像分析系統——RootViz FS
日期:2018-03-13 13:27:13

美國(guo)Phenotype Screening公司的植物根(gen)系X射(she)線(xian)掃描成(cheng)像分析系統(tong)RootViz FS是(shi)在美國(guo)能源部創新(xin)項目資助(zhu)下研發成(cheng)功的一套新(xin)型、高效率、高精度、非(fei)破壞性的測(ce)量系統(tong),用于對盆栽(zai)植物的根(gen)系進行原(yuan)位成(cheng)像分析,可以拍攝根(gen)系的立體X射(she)線(xian)照片(pian)。

這套系(xi)(xi)(xi)(xi)統(tong)(tong)是植(zhi)物(wu)根(gen)(gen)(gen)(gen)系(xi)(xi)(xi)(xi)研究領域繼(ji)根(gen)(gen)(gen)(gen)視(rhizotron)系(xi)(xi)(xi)(xi)統(tong)(tong)(如(ru)加拿(na)大(da)Regent WinRHIZO根(gen)(gen)(gen)(gen)系(xi)(xi)(xi)(xi)分(fen)(fen)(fen)析(xi)(xi)系(xi)(xi)(xi)(xi)統(tong)(tong))后(hou)激動(dong)人心的(de)(de)發明。根(gen)(gen)(gen)(gen)視系(xi)(xi)(xi)(xi)統(tong)(tong)需要將根(gen)(gen)(gen)(gen)取出清洗(xi)后(hou),借助掃描儀進(jin)(jin)行(xing)分(fen)(fen)(fen)析(xi)(xi),這個(ge)過(guo)程往(wang)往(wang)會折(zhe)斷植(zhi)物(wu)的(de)(de)根(gen)(gen)(gen)(gen)尖(jian)等脆弱部分(fen)(fen)(fen),而且屬于離體(ti)分(fen)(fen)(fen)析(xi)(xi),不能進(jin)(jin)行(xing)動(dong)態(tai)監測(ce)。而植(zhi)物(wu)根(gen)(gen)(gen)(gen)系(xi)(xi)(xi)(xi)X射(she)線掃描成(cheng)像分(fen)(fen)(fen)析(xi)(xi)系(xi)(xi)(xi)(xi)統(tong)(tong)是非(fei)破壞性的(de)(de)原位分(fen)(fen)(fen)析(xi)(xi)系(xi)(xi)(xi)(xi)統(tong)(tong),可(ke)以(yi)全方位分(fen)(fen)(fen)析(xi)(xi)植(zhi)物(wu)根(gen)(gen)(gen)(gen)系(xi)(xi)(xi)(xi)所有部分(fen)(fen)(fen)(包括根(gen)(gen)(gen)(gen)尖(jian)等),并(bing)且可(ke)以(yi)在植(zhi)物(wu)生長(chang)的(de)(de)不同階段對根(gen)(gen)(gen)(gen)系(xi)(xi)(xi)(xi)的(de)(de)生長(chang)進(jin)(jin)行(xing)長(chang)期動(dong)態(tai)監測(ce)。這套系(xi)(xi)(xi)(xi)統(tong)(tong)非(fei)常適合于研究植(zhi)物(wu)根(gen)(gen)(gen)(gen)系(xi)(xi)(xi)(xi)對脅迫的(de)(de)動(dong)態(tai)響應,可(ke)對株高高達(da)2.0m,根(gen)(gen)(gen)(gen)系(xi)(xi)(xi)(xi)深達(da)1.0 m的(de)(de)植(zhi)株進(jin)(jin)行(xing)分(fen)(fen)(fen)析(xi)(xi)。



系統特點

l  非入侵性

l  非破壞性(xing)

l  高效率(lv)

l  高精度

l  信(xin)息(xi)量大

l  可控條件下長期監測

l  根(gen)系生長(chang)發育動(dong)態研究

l  根系表型(xing)研究

X光根系.jpg


主(zhu)要(yao)功(gong)能

?原位(wei)、非破壞的研究植物(wu)根系

?全方位分(fen)析(xi)植物根系所有(you)部(bu)分(fen)

?長(chang)期監測(ce)植物(wu)根系的生長(chang)動態

?大容量、高效率(lv)、高精度的獲取根(gen)系信息

?大批量快速篩選根系(xi)突變株

?完全可控條件下根系的(de)生理、病理研究

?植物莖稈的無損檢測

?植物種子的無損檢測


技術原(yuan)理

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系統組成(cheng)

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工作流程

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應用領域




應用實例一:根系生長發育的動態監測





應用案例一.JPG



玉米出苗后 40 天的根系動態生長監測 



利用/立體眼鏡可以觀看立體效果 



應用實例二:不同品種間根系的差異






應用案例二.JPG



         相對較大的角度分布,        

   相對較短、較粗的根           

         相對較小的角度分布,

         相對(dui)較(jiao)長、較(jiao)細的根(gen)



兩種(zhong)水(shui)稻(dao)(Ra4993 和 Ra5531)的不(bu)同變種(zhong)間(jian)根系(xi)的差(cha)異,利用植物根系(xi)X-光掃(sao)描(miao)成像分(fen)析(xi)系(xi)統(tong)可以容易的進行分(fen)析(xi),而(er)傳統(tong)的洗根后掃(sao)描(miao)的方法會將根系(xi)間(jian)的角度差(cha)別忽(hu)略掉



利用/立體眼鏡可以觀看立體效果



應用實例三:根系系統分類






應用案例三.JPG



利用肉(rou)眼(yan)很(hen)難區(qu)分(fen)(fen)不同變(bian)種(zhong)(zhong)(zhong)的(de)植(zhi)物(wu)(wu)根(gen)(gen)(gen)系(xi)。而(er)借助(zhu)植(zhi)物(wu)(wu)根(gen)(gen)(gen)系(xi)X-光(guang)掃描(miao)成像分(fen)(fen)析系(xi)統(tong)結果,以側根(gen)(gen)(gen)密(mi)度和主(zhu)根(gen)(gen)(gen)長(chang)度為(wei)坐標軸得(de)出的(de)散點(dian)圖,可(ke)以對大豆(dou)變(bian)種(zhong)(zhong)(zhong)的(de)根(gen)(gen)(gen)系(xi)進行分(fen)(fen)類。上(shang)圖中(zhong),多根(gen)(gen)(gen)變(bian)種(zhong)(zhong)(zhong)分(fen)(fen)布(bu)(bu)于中(zhong)心線的(de)上(shang)部,而(er)正常品(pin)種(zhong)(zhong)(zhong)分(fen)(fen)布(bu)(bu)于中(zhong)心線的(de)下部。將這兩個(ge)品(pin)種(zhong)(zhong)(zhong)雜交(jiao)后,這種(zhong)(zhong)(zhong)方法(fa)可(ke)用于快(kuai)速掃描(miao)后代的(de)多根(gen)(gen)(gen)特性。



應用實例四:根系對脅迫響應



特制培養(yang)介質不含營(ying)(ying)養(yang)鹽、水(shui)分和(he)任何害蟲(chong),因此研(yan)究人員可(ke)方便(bian)的添(tian)加(jia)不同營(ying)(ying)養(yang)鹽、水(shui)分和(he)害蟲(chong)進(jin)行脅(xie)迫響應研(yan)究。



應用案例四.JPG



根瘤線(xian)蟲的(de)計數測量,上圖(tu)是(shi)演示的(de)根瘤隨時間(jian)的(de)變(bian)化(hua)而(er)變(bian)化(hua)的(de)趨勢圖(tu)



應用實例五:植物莖桿的X光成像研究





應用案例五.JPG



通過低能的(de)X光成像(xiang)技術可以無(wu)損的(de)檢(jian)測玉米的(de)果穗(sui)莖(jing),上圖為實際獲得的(de)玉米果穗(sui)莖(jing)的(de)圖片



應用實例六:種子X光成像研究





應用案例六.JPG



無損研究植物種子內部的結構(gou),比較同種不同個體之間(jian)的差異,上圖為(wei)玉米種子成(cheng)像圖片(pian)



應用實例(li)七:棉(mian)桃X光成像研究





應用案例七-1.JPG



應用案例七-2.JPG



通(tong)過立(li)(li)體眼鏡查看棉桃(tao)內部(bu)的立(li)(li)體結構,可以分析棉桃(tao)內部(bu)不同部(bu)位的詳細信息,上圖(tu)為棉桃(tao)內部(bu)立(li)(li)體圖(tu)片



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主要技術參數




1.1工作條件:

?  環境溫度(du):-5~+45℃

?  相對濕(shi)度(du):0-80%

?  適(shi)用(yong)電源:220-240 VAC

1.2 技術規格與要求:

1.2.1技術規格

1m系統:

?  主機:1.870(高)x 0.915(長)x 0.610(寬)m

?  X射線發射器 (50 kVp, 鎢靶, 光斑(ban)直徑(jing)~35μm,工作(zuo)強度25kVp,0.3mA)

?  數碼X射線相機 ( 2940 x 2304像素)

?  植物樣品(pin)定位系統(垂直方(fang)向1m可(ke)調,水平(ping)方(fang)向38cm可(ke)調,可(ke)360度旋轉)

?  X射線防護裝置(zhi) (內鎖和指示燈,中/英文標簽(qian))

?  主(zhu)控電腦:Win7 64位英文系統(tong),1000 G數(shu)據(ju)存儲,X射線(xian)系統(tong)控制及圖像獲取系統(tong)

?  圖形圖像分析電腦:Linux Mint 64位操作(zuo)系統,32G內(nei)存,圖像處理系統

?  速度(du):平面圖≥20株(zhu)(zhu)/h;立(li)體(ti)圖≥15株(zhu)(zhu)/h

?  測量范圍(wei):最大根長≤1.0 m;最大植物高度(du)≤2.0m

?  “R”型固定(ding)架,45x200x1000 mm培養(yang)盆(pen)和相應培養(yang)介質

?  “Q”型固定架,45x200x500 mm培養盆和相應培養介質

0.5m系統:

?  主機: 1.829(高)x 0.915(長)x 0.610(寬)m

?  X射線發射器(qi) (50 kVp, 鎢靶, 光斑(ban)直徑(jing)~35μm,工作強(qiang)度(du)25kVp,0.3mA)

?  數碼X射線相機 ( 2940 x 2304像素)

?  植物(wu)樣(yang)品(pin)定(ding)位系(xi)統(垂直方(fang)向(xiang)0.5m可調(diao),水平方(fang)向(xiang)38cm可調(diao),可360度旋轉)

?  X射線防護裝置(zhi) (內鎖和指示(shi)燈(deng),中/英文標簽)

?  主控電(dian)腦:Win7 64位英文(wen)系統(tong),1000 G數據存(cun)儲,X射線(xian)系統(tong)控制及圖像獲取(qu)系統(tong)

?  圖形圖像(xiang)分析電腦:Linux Mint 64位操作(zuo)系(xi)統,32G內存,圖像(xiang)處(chu)理系(xi)統

?  速度:平(ping)面圖(tu)≥20株/h;立體圖(tu)≥15株/h

?  測量(liang)范圍:最大根(gen)長(chang)≤0.5 m;最大植物高度≤2.0m

?  “Q”型(xing)固定架(jia)45x200x500 mm培(pei)養盆(pen)和相應培(pei)養介質(zhi)

 

1.3 可獲取參數

1.3.1 使用ImageJ協助處理圖片得到 植物根長、根夾角和根系空間分布圖(相對于中心軸)。

1.3.2 Rhizo Traits根系分析軟件(選配)

?  總根(gen)長(chang)、總投影面積和總體積;

?  可獲取5種以上不(bu)同等(deng)級根系(xi)分布圖片以及不(bu)同等(deng)級根系(xi)的根長和投影(ying)面積;

?  不(bu)同(tong)深度根系分布的位置;

?  不(bu)同(tong)深度根系的直徑(jing);

  ? 不(bu)同深度根系分(fen)布的密度。


產地:美國 Phenotype Screening 公司



選購指南:

系(xi)統(tong)

功能


1m系統

測量范(fan)圍:最大根長≤1.0 m;最大植物高(gao)度≤2.0m

推(tui)薦

0.5m系統(tong)

測量范圍:最大(da)根(gen)長≤0.5 m;最大植物高度≤2.0m

可選(xuan)

防(fang)護箱

帶(dai)安防開關,安全防護

必選

培養(yang)系統

“R”型固定架,45x200x1000 mm培養盆和相應(ying)培養介質(僅適用于1m系統)

“Q”型固(gu)定架,45x200x500 mm培養(yang)盆和相應培養(yang)介(jie)質

推薦

可選(xuan)

水肥系統(tong)

恒溫,定時灌溉

可選



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