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CytoSense 在微生物檢測中的應用
日期:2023-03-16 13:24:02
1、前言

每種(zhong)(zhong)微生(sheng)物(wu)基本都有(you)各(ge)自的(de)特異性表(biao)面抗原(yuan),使用單(dan)抗偶聯(lian)各(ge)種(zhong)(zhong)熒(ying)光素可方便檢測各(ge)種(zhong)(zhong)樣品(pin)中(zhong)的(de)微生(sheng)物(wu)。樣品(pin)經熒(ying)光染色(se)(如(ru)SYBR Green I 或(huo)其他染色(se)劑(ji)染色(se))后(hou),可用CytosSense 測定微生(sheng)物(wu)含量。(高通(tong)量:>200000cell ; 粒徑(jing):0.1-700μm) ,目前可直接檢測大腸桿(gan)菌,嗜血桿(gan)菌、沙(sha)門(men)氏(shi)菌、結核(he)桿(gan)菌、銅綠假單(dan)胞菌、軍(jun)團桿(gan)菌等(deng)。在瑞士,FCM方法(fa)被列為標準(zhun)細菌監測方法(fa)。

常用核酸染料(liao):
SYBR Green I ——滲透膜(mo),檢測活細胞(bao)。
PI (碘(dian)化丙定) ——不滲(shen)透膜(mo)(mo),只能通過破損(sun)的細胞膜(mo)(mo),檢測死細胞。
當然(ran),也可以根據檢測目(mu)的(de)選擇其他激光(guang)波長和熒光(guang)帶與目(mu)標染料進行最佳(jia)匹配染色。
488nm激(ji)光器可激(ji)發多種熒光素(su)

圖123031503.jpg


2、CytoSense 檢測微生物所需配置

2.1 激光檢測器配置:488nm激光器,綠/黃檢測熒光通道。

2.2 進樣系統設置:使用CytoSense 檢測細菌時我們建議在樣品泵中使用特殊的管道,以盡量減少染色細胞粘附在管道上,對其他操作沒有影響。即更換下圖配件:

圖223031503.jpg

2.3 鞘液設置

A) 實驗室手動染色樣品

如果(guo)樣品(pin)制備(bei)中(zhong)進行了細胞(bao)清洗,則直接上(shang)機檢測(ce)沒(mei)有影響;如果(guo)樣品(pin)沒(mei)有清洗,樣品(pin)含有游(you)離染料,則有兩種選擇:

a)“正常(chang)使用循環(huan)鞘(qiao)液(ye)”:為防止染(ran)料(liao)在鞘(qiao)液(ye)中積聚,緩慢增(zeng)加(jia)熒光通道中的背景信號(hao),因此(ci)建議(yi)定期投加(jia)氯(lv)。可以(yi)通過安裝加(jia)氯(lv)泵(beng)實現自動化,或者,我(wo)們可以(yi)安裝一個帶(dai)有流動開(kai)關的特殊過濾(lv)器(qi)(下(xia)圖),以(yi)從鞘(qiao)液(ye)中去除染(ran)料(liao)。

圖323031503.jpg

b) 使用(yong)(yong)“非循環鞘液(ye)(ye)(ye)系統”:可(ke)將“受污(wu)染”的鞘液(ye)(ye)(ye)會(hui)立即從儀器(qi)中(zhong)排出(chu),無需再(zai)循環,本方案只需為鞘液(ye)(ye)(ye)提供足夠的清潔水(shui)。外(wai)置鞘液(ye)(ye)(ye)系統有(you)利于保護管路和內置的過濾系統,延長其使用(yong)(yong)壽命。濁度(du)較高(gao)的樣(yang)(yang)品(pin),藻濃度(du)較高(gao)的樣(yang)(yang)品(pin),也可(ke)以使用(yong)(yong)外(wai)置鞘液(ye)(ye)(ye)系統來運行(xing)儀器(qi)。


外置鞘液系統連接方式如下:(標準CytoSense即可,用(yong)戶(hu)可方便自行改(gai)裝)

圖423031503.jpg

非(fei)循環外置鞘液系統(tong)


B) 現場自動染色監測

增加配件 “細菌染色(se)模(mo)塊”,可以(yi)自動調節鞘液。同時 “染色(se)模(mo)塊”,可以(yi)實現自動染色(se)。適用于水中微生物我(wo)的在線自動監測(ce)。


使用方法:與正常細胞檢(jian)測一樣,沖洗(xi)、啟動和(he)分析(xi)操作是自動化的,所有(you)程(cheng)序都在軟件中編(bian)寫。熒光染料有(you)時需要在瓶子(zi)空(kong)了(le)之后重新(xin)填充(chong),定期(qi)更換氯和(he)過濾器-取決于使用情況(kuang)等,可自動運行(xing)幾個月。

圖523031503.jpg

※ 對于已經擁有CytoSense的最終用戶,不需要購買另一臺CytoSense,只需加配染色模塊,對現有CytoSense做微小調整,以適應與染色模塊的耦合(如電子連接和安裝不同類型的樣品泵)。


3、應用案例

3.1 上升流系統和人為活動對巴西沿海地區微生物多樣性的影響(巴西里約熱內盧聯邦大學)

圖623031503.jpg

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細菌活性測定
利用CytoSense 測定(ding)細菌(jun)濃(nong)度,配置488nm,20mV固體(ti)藍(lan)色(se)(se)(se)激光(guang)(guang),側向散射(SWS,446/500nm)檢測器和紅色(se)(se)(se)(葉綠(lv)素-a)熒(ying)光(guang)(guang)(FL1-669/725nm);橙(cheng)色(se)(se)(se)/黃色(se)(se)(se)(FL-2,601/651nm),綠(lv)色(se)(se)(se)/黃色(se)(se)(se)(FL-3,515/585nm)熒(ying)光(guang)(guang)檢測器。使0.92和10mm的黃綠(lv)色(se)(se)(se)熒(ying)光(guang)(guang)小球作為(wei)內標,并(bing)使用Length,SWS和Average,OFL參數進(jin)行細菌(jun)計(ji)數現場測定(ding)。細菌(jun)樣本使用SYBER Green I 染色(se)(se)(se),通(tong)過(guo)側向散射SWS和橙(cheng)色(se)(se)(se)熒(ying)光(guang)(guang)信號進(jin)行鑒別。

圖723031503.jpg

3.2 CytoSense分析大容量沖擊采樣器采集的空氣中細菌(丹麥奧胡斯大學)

圖823031503.jpg

空氣(qi)中(zhong)(zhong)細(xi)(xi)菌細(xi)(xi)胞(bao)的(de)(de)(de)特性需要(yao)有效的(de)(de)(de)收(shou)集(ji)、濃縮和分(fen)析技術(shu),特別是要(yao)克服它(ta)們在(zai)室外環(huan)境(jing)中(zhong)(zhong)被稀釋(shi)的(de)(de)(de)挑戰(zhan)。建立了(le)一種快速、可(ke)靠的(de)(de)(de)空氣(qi)中(zhong)(zhong)細(xi)(xi)菌定量方(fang)法(fa)。為(wei)此,采用大容(rong)積沖擊(ji)取樣器從污水處(chu)理廠(chang)(WWTP)收(shou)集(ji)空氣(qi)中(zhong)(zhong)的(de)(de)(de)細(xi)(xi)菌。用CytoSense測定細(xi)(xi)菌細(xi)(xi)胞(bao)密(mi)度,并與基(ji)于16srRNA基(ji)因的(de)(de)(de)定量PCR(qPCR)數(shu)據(ju)進行(xing)比(bi)較。結果表明,該(gai)方(fang)法(fa)對(dui)室外環(huan)境(jing)中(zhong)(zhong)細(xi)(xi)菌密(mi)度的(de)(de)(de)估計是可(ke)靠的(de)(de)(de),用CytoSense法(fa)進行(xing)分(fen)析比(bi)qPCR法(fa)更快、更靈敏(min)。此外,在(zai)不同的(de)(de)(de)取樣條件下,CytoSense可(ke)提供有價值的(de)(de)(de)細(xi)(xi)胞(bao)特征信息(xi)。

圖9230315032.jpg

利采用CytoSense對沖(chong)(chong)擊式氣(qi)體采樣器收集到的氣(qi)載細(xi)菌和參(can)考(kao)菌株大(da)腸桿(gan)菌進行(xing)計數和鑒(jian)定。配置488nm激(ji)光(guang)器,550nm的高靈敏度黃(huang)光(guang)發射傳(chuan)感器。同(tong)時記錄每個粒(li)子(zi)的脈沖(chong)(chong)形狀(zhuang)的信號(hao)可用于(yu)估計細(xi)胞體積,并將細(xi)胞定義為(wei)不同(tong)細(xi)胞類型的特定簇。分(fen)析粒(li)子(zi)體積通過FWS的掃描脈沖(chong)(chong)圖或SWS的掃描脈沖(chong)(chong)圖估算。

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3.3 絲狀菌生物過程中的孢子質量在線監測(維也納科技大學)

圖1023031503.jpg

真菌(jun)生(sheng)物過程(cheng)中孢(bao)(bao)子(zi)(zi)(zi)(zi)接(jie)(jie)種(zhong)物質量(liang)的測定尤為重(zhong)要(yao),因(yin)(yin)為萌發(fa)(fa)孢(bao)(bao)子(zi)(zi)(zi)(zi)的數量(liang)會影響(xiang)過程(cheng)性(xing)能(neng),進(jin)而(er)影響(xiang)產品(pin)效價。因(yin)(yin)此,需要(yao)確定孢(bao)(bao)子(zi)(zi)(zi)(zi)接(jie)(jie)種(zhong)體(ti)中活(huo)孢(bao)(bao)子(zi)(zi)(zi)(zi)的濃度(du),以便(bian)將(jiang)精確數量(liang)的活(huo)孢(bao)(bao)子(zi)(zi)(zi)(zi)接(jie)(jie)種(zhong)到生(sheng)物反應器中。根(gen)據(ju)孢(bao)(bao)子(zi)(zi)(zi)(zi)接(jie)(jie)種(zhong)體(ti)的不同(tong),孢(bao)(bao)子(zi)(zi)(zi)(zi)需要(yao)不同(tong)的時間段膨(peng)脹(zhang)、萌發(fa)(fa),從而(er)生(sheng)長菌(jun)絲。本(ben)文提出(chu)的方法不僅可以取(qu)代(dai)菌(jun)落形成單(dan)元(CFU)測定法,而(er)且(qie)可以在線監測孢(bao)(bao)子(zi)(zi)(zi)(zi)的溶(rong)脹(zhang)和萌發(fa)(fa)。
* 活(huo)(huo)菌染色熒光素二乙酸酯(FDA)和(he)(he)碘(dian)化丙二鈉(PI)能夠區分代謝活(huo)(huo)性(xing)/活(huo)(huo)菌/FDA陽性(xing)孢子和(he)(he)非活(huo)(huo)菌孢子

圖.jpg

3.4 高頻監測水生生態系統中異氧微生物的原位特征及動態(地中海海洋研究所)

自(zi)動染色模塊(SM)安裝于CytoSense,可(ke)同時原位自(zi)動采(cai)樣、分(fen)析浮游(you)(you)植(zhi)物(wu)和細菌。水(shui)樣在(zai)行船過(guo)程(cheng)中(zhong)持續(xu)泵入系統,SYBR Green I熒光(guang)染料通(tong)過(guo)小的染色容器逐(zhu)滴加入樣品(pin)(V/V=1:10000),經15min 染色反(fan)應后自(zi)動泵入CytoSense。通(tong)過(guo)本次項目(mu)地中(zhong)海海洋研究(jiu)所展示了CytoSense 不(bu)僅可(ke)以檢(jian)測自(zi)發熒光(guang)的浮游(you)(you)植(zhi)物(wu),而且可(ke)檢(jian)測細菌、鞭毛蟲、纖毛蟲等微生物(wu)。經過(guo)2 小時一次共七天的實驗,獲得了更多有效數(shu)據。

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4、參考文獻

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[7] Ehgartner, D., Fricke, J., Schr?der, A., & Herwig, C. (2016). At-line determination of spore germination of Penicilliumchrysogenumbioprocesses in complex media. Fungal Genetics and Biology, Manuskript in preparation.


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